Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TARSL2A2RTX5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms