Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEB3A0JP26 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms