Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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