Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNX8Q9Y5X2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms