Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms