Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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