Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SBNO2Q9Y2G9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms