Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms