Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG5Q9UPR3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms