Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAL4Q9UM19 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms