Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms