Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms