Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRAQ9UJ68 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms