Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms