Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms