Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms