Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms