Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms