Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP35Q9P2H5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms