Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHRF1Q9P1Y6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms