Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms