Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CWC15Q9P013 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC15Q9P013 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms