Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms