Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms