Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms