Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM28Q9NW13 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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