Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms