Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A7Q9NVC3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms