Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms