Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST12Q9NRB3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST12Q9NRB3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms