Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms