Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms