Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms