Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms