Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms