Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms