Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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FOXQ1Q9C009 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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FOXQ1Q9C009 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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FOXQ1Q9C009 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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FOXQ1Q9C009 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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