Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms