Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms