Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK19Q9BWU1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK19Q9BWU1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms