Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms