Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT1Q99943 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms