Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms