Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms