Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms