Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms