Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCANQ96GW7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 487.2 ms