Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC11Q96DB2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms