Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC47Q96A33 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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