Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms